Bulletin n°312
Sommaire
Biologie
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Aberrations chromosomiques (2)
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A partir de 95 échantillons plasmatiques prélevés sur 43 patients atteints d'un cancer métastatique de la prostate, cette étude met en évidence un haut degré de plasticité du génome tumoral au cours de la progression de la maladie
Whole-genome plasma sequencing reveals focal amplifications as a driving force in metastatic prostate cancer
Nature Communications, article en libre accès, 2015
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A partir de données issues du projet "The Cancer Genome Atlas" et menée in vitro, cette étude évalue l'intérêt d'un algorithme pour caractériser les conséquences fonctionnelles de mutations somatiques et, notamment, prédire la sensibilité de cellules cancéreuses à une thérapie ciblée
Functional characterization of somatic mutations in cancer using network-based inference of protein activity
Nature Genetics, résumé, 2015
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Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (2)
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Menée à l'aide d'un modèle murin de carcinome épidermoïde bronchique, cette étude met en évidence le rôle joué par deux récepteurs des oxystéroles dans le développement d'une tumeur
Ablation of Liver X receptors α and β leads to spontaneous peripheral squamous cell lung cancer in mice
Proceedings of the National Academy of Sciences, résumé, 2016
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Menée sur des lignées cellulaires de cancer colorectal et à l'aide de xénogreffes, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels un gène PI3KCA muté induit une dépendance à la glutamine des cellules cancéreuses
Oncogenic PIK3CA mutations reprogram glutamine metabolism in colorectal cancer
Nature Communications, article en libre accès, 2015
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Progression et métastases (4)
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Menée sur des lignées cellulaires et à l'aide d'un modèle murin de leucémie myéloïde aiguë MLL-AF9, cette étude identifie plusieurs gènes impliqués dans la transition épithélio-mésenchymateuse puis, à l'aide de données portant sur des patients, montre que l'expression de ces gènes est associée à un pronostic défavorable
MLL-AF9 Expression in Hematopoietic Stem Cells Drives a Highly Invasive AML Expressing EMT-Related Genes Linked to Poor Outcome
Cancer Cell, résumé, 2015
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Menée sur deux patients atteints d'un mélanome de stade IV traité à l'aide d'un transfert adoptif de lymphocytes T, cette étude met en évidence la dynamique des interactions entre les cellules cancéreuses et les lymphocytes T
Neoantigen landscape dynamics during human melanoma–T cell interactions
Nature, résumé, 2015
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A partir de données issues du projet "The Cancer Genome Atlas" et de 98 échantillons de tumeurs primitives et métastatiques prélevés sur des patientes atteintes d'un cancer métastatique de l'endomètre, cette étude montre notamment que les métastases se développent fréquemment à partir d'une population sous-clonale non détectée lors de la biopsie de la tumeur primitive
The genomic landscape and evolution of endometrial carcinoma progression and abdominopelvic metastasis
Nature Genetics, résumé, 2015
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Menée à l'aide d'un modèle murin génétiquement modifié de cancer du poumon à petites cellules, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels le facteur de transcription Nfib favorise le processus métastatique
Nfib Promotes Metastasis through a Widespread Increase in Chromatin Accessibility
Cell, article en libre accès, 2015
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Ressources et infrastructures (1)
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Cette étude présente un algorithme appelé PiCnIc ("Pipeline for Cancer Inference") visant à identifier l'évolution somatique sous-jacente d'un ensemble de tumeurs à partir de données de séquençage à haut débit
Algorithmic methods to infer the evolutionary trajectories in cancer progression
Proceedings of the National Academy of Sciences, résumé, 2016
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