Bulletin n°346
Sommaire
Biologie
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                            Aberrations chromosomiques (3)- 
                                                                        
A partir de données issues du projet "The Cancer Genome Atlas", cette étude identifie des associations entre des mutations en mosaïque de l'ADN, détectées dans le sang, et diverses tumeurs solides (ovaire, glioblastome, mélanome, poumon) Mosaic mutations in blood DNA sequence are associated with solid tumor cancers Npj Genomic Medicine, article en libre accès, 2017 
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A partir de 489 échantillons tumoraux prélevés dans 10 pays sur des patients atteints d'un cholangiocarcinome, cette étude identifie un ensemble d'anomalies génomiques et épigénomiques en association avec différents sous-types définis par leur étiologie, notamment une infection par la douve du foie Whole-Genome and Epigenomic Landscapes of Etiologically Distinct Subtypes of Cholangiocarcinoma Cancer Discovery, résumé, 2016 
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A partir de 278 échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un cancer primitif du côlon, cette étude identifie plusieurs fusions de gènes associées à une fonction oncogénique A Systematic Analysis of Oncogenic Gene Fusions in Primary Colon Cancer Cancer Research, résumé, 2016 
 
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                            Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (4)- 
                                                                        
Menée sur des lignées cellulaires cancéreuses, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en se liant à la protéine suppresseur de tumeurs DAB2IP et en augmentant l'activation de la signalisation AKT1, une protéine issue d'un gène p53 muté favorise la prolifération cellulaire en réponse à un apport d'insuline Mutant p53 potentiates the oncogenic effects of insulin by inhibiting the tumor suppressor DAB2IP Proceedings of the National Academy of Sciences, résumé, 2017 
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Menée in vitro sur des modèles de myélome multipe, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en lien avec une amplification de la région chromosomique 1q21, une surexpression de la protéine ILF2 favorise la tolérance à l'instabilité génomique des cellules cancéreuses ILF2 Is a Regulator of RNA Splicing and DNA Damage Response in 1q21-Amplified Multiple Myeloma Cancer Cell, résumé, 2016 
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Menée sur des lignées cellulaires de cancer du sein et à l'aide de xénogreffes sur des modèles murins, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels la protéine NEMO régule l'expression de la protéine suppresseur de tumeurs PML NEMO, a Transcriptional Target of Estrogen and Progesterone, Is Linked to Tumor Suppressor PML in Breast Cancer Cancer Research, résumé, 2016 
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Menée in vitro et in vivo sur des modèles de lymphome T et de sarcome, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels la protéine Mdm2 favorise la prolifération des cellules cancéreuses n'exprimant pas le gène p53 Mdm2 Is Required for Survival and Growth of p53-Deficient Cancer Cells Cancer Research, résumé, 2016 
 
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                            Progression et métastases (5)- 
                                                                        
Cet article passe en revue les travaux récents sur les mécanismes par lesquels les mitochondries régulent le processus métastatique Mitochondria on the move: emerging paradigms of organelle trafficking in tumour plasticity and metastasis British Journal of Cancer, article en libre accès, 2016 
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Menée in vitro et in vivo sur des modèles de glioblastome, cette étude identifie notamment le rôle joué in vivo par une enzyme, le facteur d'élongation du mécanisme de transcription JMJD6, dans la survie des cellules cancéreuses Transcription elongation factors represent in vivo cancer dependencies in glioblastoma Nature, résumé, 2016 
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Menée in vitro et in vivo sur des modèles de mélanome, cette étude met en évidence le rôle joué par la protéine SOCS2 et l'interféron gamma dans des mécanismes immunitaires se développant dans le micro-environnement tumoral IFNgamma-Dependent Tissue-Immune Homeostasis Is Co-opted in the Tumor Microenvironment Cell, résumé, 2016 
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Dossier A partir d'échantillons de tumeurs primitives, de ganglions lymphatiques et de métastases distantes prélevés sur 17 patients atteints d'un cancer colorectal (213 échantillons au total), cette étude montre notamment que, dans 65% des cas, les métastases distantes et lymphatiques se sont formées à partir de populations sous-clonales indépendantes présentes dans la tumeur primitive - 
                                            
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Origins of lymphatic and distant metastases in human colorectal cancer Science, résumé, 2016 
 
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Menée in vitro et in vivo sur des modèles de cancer colorectal, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels la protéine LIMK1, impliquée dans la régulation de l'organisation du cytosquelette, favorise le processus métastatique LIM kinase 1 interacts with myosin-9 and alpha-actinin-4 and promotes colorectal cancer progression British Journal of Cancer, résumé, 2016 
 
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                            Ressources et infrastructures (4)- 
                                                                        
A partir d'échantillons de tissu tumoral et de tissu sain prélevés sur 54 patients atteints d'un carcinome hépatocellulaire, cette étude met en évidence l'existence d'un gradient de cellules immunitaires à travers le micro-environnement tumoral, le micro-environnement non tumoral et le sang périphérique Delineation of an immunosuppressive gradient in hepatocellular carcinoma using high-dimensional proteomic and transcriptomic analyses Proceedings of the National Academy of Sciences, article en libre accès, 2017 
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Cet article présente un ensemble de recommandations pour l'usage d'identifiants permanents dans les données en sciences de la vie afin de faciliter leur intégration en ligne à large échelle Identifiers for the 21st century: How to design, provision, and reuse persistent identifiers to maximize utility and impact of life science data PLoS Biology, article en libre accès, 2016 
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Menée à l'aide de questionnaires auprès de 196 chercheurs opérant dans le domaine du cancer, cette étude évalue leur capacité à prédire la reproductibilité de 6 études précliniques ayant fait l'objet d'une tentative de réplication dans le cadre du projet "Reproducibility Project: Cancer Biology" Can cancer researchers accurately judge whether preclinical reports will reproduce? PLoS Biology, article en libre accès, 2016 
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Cet article passe en revue les travaux récents sur le rôle joué par des anomalies du processus d'édition de l'ARN dans la cancérogenèse 
 
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