Bulletin n°539
Sommaire
Dépistage, diagnostic, pronostic
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Découverte de technologies et de biomarqueurs (3)
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Menée à partir de données de méthylation de l'ADN portant sur des échantillons de neuroblastomes, cette étude identifie de nouveaux sous-groupes moléculaires associés au pronostic
Genome wide DNA methylation analysis identifies novel molecular subgroups and predicts survival in neuroblastoma
British Journal of Cancer, article en libre accès, 2022
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Menée à partir de l'analyse de l'ascendance génétique de plus de 2 000 patients présentant un même type de tumeur solide traitée par inhibiteurs de points de contrôle immunitaires, cette étude analyse, en fonction de cette ascendance, la corrélation entre la charge mutationnelle de la tumeur et les résultats cliniques
Ancestry-driven recalibration of tumor mutational burden and disparate clinical outcomes in response to immune checkpoint inhibitors
Cancer Cell, article en libre accès, 2021
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Menée à partir de données portant sur la méthylation de l'ADN de 1 228 échantillons tissulaires et validée à partir de données portant sur plus de 500 échantillons supplémentaires, cette étude évalue la performance d'un algorithme d'apprentissage automatique, exploitant des données de méthylation de l'ADN, pour détecter différents types de tumeurs rénales, malignes ou bénignes
Accurate detection of benign and malignant renal tumor subtypes with MethylBoostER: An epigenetic marker–driven learning framework
Science Advances, article en libre accès, 2021
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Essais de technologies et de biomarqueurs dans un contexte clinique (2)
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Menée à partir d'échantillons urinaires prélevés sur 73 patients atteints d'un cancer de la vessie ou présentant des troubles urologiques bénins puis menée sur 478 patients sous surveillance médicale, cette étude multicentrique évalue la performance de tests, basés sur deux panels de biomarqueurs peptidiques (BC-116 et BC-106), pour détecter un cancer primitif de la vessie ou une récidive
Multicentric validation of diagnostic tests based on BC-116 and BC-106 urine peptide biomarkers for bladder cancer in two prospective cohorts of patients
British Journal of Cancer, résumé, 2022
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Menée à partir de l'analyse du microbiome intestinal et de l'alimentation de patients néerlandais, australiens ou américains atteints d'un mélanome de stade III ou IV, cette étude met en évidence une association entre le microbiote intestinal induit par l'alimentation et l'efficacité ainsi que la toxicité des inhibiteurs de point de contrôle immunitaire
Diet-driven microbial ecology underpins associations between cancer immunotherapy outcomes and the gut microbiome
Nature Medicine, résumé, 2022
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Ressources et infrastructures (1)
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Cet article passe en revue les connaissances concernant le système immunitaire et le microenvironnement tumoral, présente les différentes approches immunothérapeutiques pour traiter un cancer colorectal, analyse l'utilisation de l'intelligence artificielle pour prédire l'instabilité des microsatellites et la charge mutationnelle à partir d'images numériques de lames histologiques puis examine le rôle de l'intelligence artificielle dans la découverte de nouveaux biomarqueurs et l'adoption clinique de nouvelles méthodologies pour identifier les patients pouvant bénéficier d'immunothérapies
Role of AI and digital pathology for colorectal immuno-oncology
British Journal of Cancer, article en libre accès, 2022
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Évaluation des technologies et des biomarqueurs (3)
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Menée à partir d'échantillons plasmatiques prélevés sur 171 patients atteints d'un cancer du poumon non à petites cellules de stade avancé, cette étude évalue l'intérêt de l'ADN libre circulant et de la fréquence allélique pour identifier les patients présentant un risque élevé d'hyperprogression de la maladie ou de décès précoce
Longitudinal liquid biopsy anticipates hyperprogression and early death in advanced non-small cell lung cancer patients treated with immune checkpoint inhibitors
British Journal of Cancer, article en libre accès, 2022
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Menée sur 91 patients atteints d'un cancer rectal de stade localement avancé et validée sur 27 patients supplémentaires, cette étude met en évidence l'intérêt d'organoïdes dérivés de tumeurs de patients pour prédire la réponse tumorale à une chimioradiothérapie néoadjuvante à base d'irinotécan
Patient-derived tumor organoids predict responses to irinotecan-based neoadjuvant chemoradiotherapy in patients with locally advanced rectal cancer
International Journal of Cancer, résumé, 2022
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Dossier
Menée à l'aide de l'intelligence artificielle ainsi que d'échantillons tissulaires de tumeurs et de muqueuses coliques normales provenant de patients atteints d'un cancer colorectal de stade précoce puis validée sur deux cohortes indépendantes incluant au total 797 patients, cette étude évalue la performance d'une signature épigénétique, reposant sur le profil de méthylation des régions pauvres en dinucléotide CpG de 4 gènes (FAT3, KAZN, TLE4 et DUSP3), pour établir un pronostic
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DNA Methylation Profile in CpG-depleted Regions Uncovers a High-Risk Subtype of Early-stage Colorectal Cancer
Journal of the National Cancer Institute, résumé, 2021
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A Methylation-Based Prognostic Signature in Stage II Colorectal Patients: Considerations for Clinical Adoption
Journal of the National Cancer Institute, éditorial en libre accès, 2021
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